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QuantStudio 3 在設(shè)計(jì)上能夠進(jìn)行長時間的實(shí)驗(yàn),例如在運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)96孔板時,一個典型的qPCR程序本身就需要1.5到2.5小時。儀器本身具備連續(xù)運(yùn)行24小時甚至更久的硬件能力。
然而,能否順利實(shí)現(xiàn)24小時連續(xù)運(yùn)行,關(guān)鍵在于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣品和試劑穩(wěn)定性以及無人值守的風(fēng)險管理。以下是詳細(xì)的解釋和注意事項(xiàng):
一、支持24小時運(yùn)行的理由
1、硬件設(shè)計(jì):儀器的加熱塊、光學(xué)檢測系統(tǒng)和控制軟件都支持長時間運(yùn)行。您可以輕松設(shè)置一個循環(huán)數(shù)多、退火/延伸時間長的程序,總時長超過24小時。
2、軟件支持:QuantStudio Design and Analysis 軟件允許您設(shè)置并運(yùn)行長達(dá)數(shù)天的實(shí)驗(yàn)程序。
二、實(shí)現(xiàn)24小時連續(xù)運(yùn)行的關(guān)鍵前提與注意事項(xiàng)
1、反應(yīng)體系蒸發(fā)問題(最關(guān)鍵!)
必須使用光學(xué)蓋膜或封板膜:不能直接使用普通的板蓋。需要使用專門的熱封膜(如 MicroAmp™ Optical Sealing Film)或光學(xué)透明的粘性封板膜,并用相應(yīng)的封板器將其緊密密封,防止在長時間高溫循環(huán)中液體蒸發(fā),導(dǎo)致反應(yīng)失敗和儀器污染。
驗(yàn)證密封性:確保封膜沒有褶皺或未封緊的區(qū)域。
2、試劑和酶的穩(wěn)定性
使用長效酶:普通的Taq酶在長時間高溫循環(huán)下可能會失活。如果您計(jì)劃運(yùn)行一個非常長的程序(例如超過3-4小時),強(qiáng)烈建議使用為“長片段PCR"或“長時間擴(kuò)增"設(shè)計(jì)的特殊酶 mix,這些酶具有更好的熱穩(wěn)定性。
Mix的穩(wěn)定性:確保您使用的預(yù)混液(Master Mix)制造商沒有標(biāo)明不適用于超長運(yùn)行時間。
3、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的合理性
循環(huán)數(shù):通常40個循環(huán)已經(jīng)足夠檢測絕大多數(shù)模板。設(shè)置過高的循環(huán)數(shù)(如60-80循環(huán))不僅不必要,還可能增加背景噪音和蒸發(fā)風(fēng)險。請根據(jù)您的模板濃度合理設(shè)置循環(huán)數(shù)。
程序步驟時間:延長退火/延伸時間會增加總運(yùn)行時間。請確認(rèn)您的擴(kuò)增片段長度是否需要這么長的延伸時間。
4、無人值守的風(fēng)險
電力保障:確保實(shí)驗(yàn)室供電穩(wěn)定,有UPS(不間斷電源)支持,防止意外斷電導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)中斷和數(shù)據(jù)丟失。
儀器狀態(tài):在離開前,確認(rèn)儀器運(yùn)行正常,沒有報錯信息。
環(huán)境溫度:確保儀器周圍通風(fēng)良好,環(huán)境溫度不會過高。
三、總結(jié)與建議
1、可以做到:QuantStudio 3 在技術(shù)上能夠單次連續(xù)運(yùn)行24小時。
2、不推薦常規(guī)化:除非有特殊實(shí)驗(yàn)需求(如使用特殊的長片段酶),否則不建議常規(guī)設(shè)計(jì)單次長達(dá)24小時的qPCR程序。更好的做法是優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方案,縮短運(yùn)行時間,或采用分批上樣的間歇式運(yùn)行。
3、如果必須進(jìn)行:
嚴(yán)格密封:使用高質(zhì)量的光學(xué)密封膜和封板器。
選擇穩(wěn)定試劑:確認(rèn)并使用熱穩(wěn)定性更高的酶。
進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn):先用少量樣本進(jìn)行一次長時間運(yùn)行的預(yù)實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證擴(kuò)增效率和結(jié)果是否可接受。
做好風(fēng)險管理:確保電力穩(wěn)定,并告知實(shí)驗(yàn)室相關(guān)人員。
4、總而言之,將QuantStudio 3用于24小時連續(xù)運(yùn)行在技術(shù)上是可行的,但成功與否高度依賴于您對蒸發(fā)控制和試劑穩(wěn)定性的管理。 在嘗試之前,請務(wù)必仔細(xì)評估這些風(fēng)險。